图卢兹大学院系机构20世纪60年代末，法国教育改革中，图卢兹大学分成三个独立大学 ：图卢兹第一大学（Uiniversité Toulouse I - Capitole）图卢兹第二大学（Université ToulouseII- Jean jaurès）图卢兹第三大学（Université Toulouse III - Paul Sabatier）以及若干个工程师学校

2007年3月，这些学校再度组成图卢兹大学联盟（法语：Pôle de recherche et d'enseignement supérieur Université de Toulouse），主要成员包括上述三所综合性大学以及法国国立应用科学院（INSA de Toulouse）图卢兹国立综合理工学院（INPT）高等航空航天学院（SUPAERO-ENSICA）图卢兹商学院（Toulouse Business School-ESC Toulouse ）图卢兹政治学院（Toulouse Political Studies Institute）法国国立民用航空学校（The National Civil Aviation School），国立建筑学院（Toulouse National Higher Architecture Institute）国立农学院（The National Agronomy School）国立医学院 （National Veterinary School）等

根据“2007年图卢兹高等教育法令”（decree on March 21st 2007）， 法律上属于图卢兹大学的16所院系如下：Université Toulouse I Social Sciences (Law, Economics经济法律学院)Université Toulouse II Le Mirail (Arts, Literature, Humanities and Languages人文学院)Université Toulouse III Paul Sabatier (Science, Technologies and Health理学院和医学院)Institut National Polytechnique- INPT (Engineering School工学院)Institut National des Sciences Appliquées- INSA (Applied Sciences 应用理学院)Institut Supérieur de l'Aéronautique et de l'Espace- ISAE (Aeronautics and Space航天航空学院)Toulouse Political Studies Institute (Political School 政治学院)The National Engineering School in Tarbes (Engineering School工学院)JF Champollion Teaching and Research multi-campus University （Education教育学院）Toulouse Business School－ ESC Toulouse (Business商学院)The Engineering School in Purpan (Engineering School工学院)The Engineering School in Albi-Carmaux (Engineering School工学院)The National Civil Aviation School (Aviation 飞行学院)The National Agronomy School ( Agronomy农学院 )Toulouse National Higher Architecture Institute （Architecture建筑学院）Toulouse National Veterinary School （Veterinary 兽医学院）

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