熊本大学学校排名2016CWUR世界大学排名中位居世界第458位，日本国内第18位
2017QS世界大学学科排名中，其药学与药理学（Pharmacy & Pharmacology）专业位居世界151-200位，并列日本国内第8位
生命科学与医学（Life Sciences and Medicine）专业位居世界第351位，日本国内第16位
2019QS世界大学排名中位居第500位，日本国内第18位
2021QS世界大学排名，位列561-570区间
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