维尔纽斯卡普苏斯大学20世纪1919年，立陶宛共和国独立，但维尔纽斯为同时独立的波兰共和国占据，大学重建，但被作为一所波兰语高等教育机构
期间，立陶宛共和国首都位于考纳斯，国立大学为维陶塔斯马格纳斯大学
1940年到1943年，大学重建，维尔纽斯回归立陶宛，成为立陶宛首都，大学重命名为维尔纽斯大学
1944年到1955年，大学重命名为维尔纽斯国立大学
1955年至1990年，大学被命名为维尔纽斯卡普苏斯大学
1990年后改为现名
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