马尔堡大学知名校友建校近五百年来，曾有许多著名学者在马尔堡大学学习或工作自然科学：埃米尔·阿道夫·冯·贝林：德国医学家，因研究白喉的血清疗法而获得1901年首届诺贝尔生理学或医学奖

卡尔·费迪南德·布劳恩：德国物理学家，1909年诺贝尔物理学奖获得者，阴极射线管的发明者

阿尔布雷希特·科塞尔：因研究细胞化学蛋白质及核酸的工作，获1910年诺贝尔生理学或医学奖获得者

汉斯·费歇尔：德国生物化学家，1930年诺贝尔化学奖获得者

奥托·勒维 ：药理学家，与亨利·哈利特·戴尔共同发现神经冲动的化学传递，获1936年诺贝尔生理学或医学奖

阿道夫·布特南特：生物化学家，由于在性激素方面的研究取得成就，于1939年获得了诺贝尔化学奖

奥托·哈恩：放射化学家、物理学家，因发现核裂变现象获得1944年诺贝尔化学奖

卡尔·齐格勒：德国有机化学家，因合成塑料用高分了研究，与G.纳塔共获1963年诺贝尔化学奖

格奥尔格·维蒂希：德国化学家，因将磷化合物用于有机合成之中而与赫伯特·布朗分享1979年诺贝尔化学奖

朱尔斯·霍夫曼：生物学家，因在免疫学领域的杰出贡献，获得2011年诺贝尔生理学或医学奖获得者

罗伯特·威廉·本生：德国化学家

阿道夫·威廉·赫尔曼·科尔贝：德国化学家

阿尔弗雷德·魏格纳：德国气象学家、地球物理学家，大陆漂移学说创立者

米哈伊尔·瓦西里耶维奇·罗蒙诺索夫：俄国科学家、语言学家、哲学家和诗人，“物质不灭理论”雏形的提出者

马尔堡大学的人文学科底蕴深厚，尤其是神学与哲学

神学家：鲁道夫·布尔特曼：德国神学家、《新约》学家

威尔汉·赫尔曼：德国籍新教神学家、系统神学家

保罗·田立克：新教神学家、新正统神学家、存在主义神学家，被视为美国的存在主义者的代表人物

卡尔·巴特：新教神学家，新正统神学的代表人物之一

哲学家：恩斯特·卡西尔：德国哲学家，新康德主义的马堡学派的主要代表人物

汉斯-格奥尔格·伽达默尔：德国哲学家，著有《真理与方法》(Wahrheit und Methode)闻名于世

马丁·海德格尔：20世纪存在主义哲学的创始人和主要代表之一

汉斯·约纳斯：德国哲学家，著有《责任命令》（The Imperative of Responsibility）

汉娜·阿伦特：20世纪思想家、政治理论家之一，著有《极权主义的起源》

何塞·奥特嘉·伊·加塞特：哲学家

列奥·施特劳斯：犹太裔德国作家、哲学家

其它领域：格林兄弟：德国著名童话作家兄弟的合称，于1812年出版《格林童话》著名童话集，共收录童话210则

威廉·李卜克内西：著名活动家，德国社会民主党领袖，第二国际创始人之一，共产主义者同盟盟员，德国社会民主党创始人和领袖之一

古斯塔夫·海涅曼：1969年至1974年任西德总统

科斯塔斯·西米蒂斯：1996年1月起到2004年3月任希腊总理

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