维尔茨堡大学重建1573年，尤利乌斯·艾希特·冯· 梅斯佩尔布伦（Julius Echter von Mespelbrunn）当选为维尔茨堡的采邑主教，并立即着手重建维尔茨堡大学的高等教育
1575年，神圣罗马帝国皇帝马克西米利安二世授予大学特权
1576 年教皇格列高利十三世重新授予大学教皇特权
1582年1月2日至4日，在尤利乌斯·艾希特·冯· 梅斯佩尔布伦采邑主教的主持下维尔茨堡大学隆重地重新开幕
大学特权的授予，神学、哲学、法律和医学学院院长的任命，都为“旧大学”和大学教堂的发展奠定了基础
1591年，拥有神学院、法律学院、哲学院和祝圣过的大学教堂的维大老大学正式竣工，而维大医学院则设在尤里乌斯（Juliusspital）医院内
1631 年瑞典人征服维尔茨堡，大学活动中断五年，图书馆收藏的部分珍贵资料被带到乌普萨拉
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