重庆公共运输职业学院院系专业截至2022年11月，学校设有6个教学单位，开设38个专业

 学院围绕交通行业发展对技术技能人才的需求设置专业，截至目前，开设了轨道车辆与机械系、轨道电气系、铁道与建筑工程系、运输贸易系、汽车工程系、人文艺术系6个系共26个专业，主干专业将与重庆轨道交通集团、重庆公交集团、重庆恒通客车制造厂、重庆长客轨道车辆有限公司、重庆城市综合交通枢纽建设集团、重庆公共交通汽车维修有限责任公司等企业开展校企合作、订单培养

其中，铁道机车车辆、铁道交通运营管理、铁道供电技术、铁道信号自动控制等专业为目前重庆市高职院校独有专业

  2019年起，学校与重庆科技学院联合开办“3+2专本贯通分段培养项目”本科专业

2019年“3+2专本贯通分段培养项目”对应本科院校及本科专业试点本科学校前三年专科段专业名称后两年本科段专业名称重庆科技学院电气自动化技术电气工程及其自动化二级学院专业名称轨道交通学院城市轨道车辆应用技术、城市轨道交通机电技术、铁道机车运用与维护、铁道供电技术、动车组检修技术、高速铁路综合维修技术智慧交通学院应用电子技术、电气自动化技术、铁道信号自动控制、城市轨道交通通信信号技术、智能交通技术、人工智能技术应用、大数据技术运输贸易学院交通运营管理、城市轨道交通运营管理、关务与外贸服务、统计与会计核算、轨道交通运营管理、市场营销智能装备学院智能焊接技术、汽车制造与试验技术、汽车检测与维修技术、汽车电子技术、机械制造及自动化、机械设计与制造、新能源汽车技术、工业机器人技术公共管理学院婴幼儿托育服务与管理、社区管理与服务、工业设计、环境艺术设计铁道与建筑学院铁道工程技术、道路与桥梁工程技术、建设工程管理、建筑工程技术信息来源 

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