云南医药健康职业学院学术资源据2023年4月学校官网显示，学校图书馆馆藏纸质图书 37.2万册，电子图书53.6万册，形成了以医学、卫生、健康为馆藏特色，兼顾马列主义、毛泽东思想、邓小平理论、哲学、政治法律、军事、经济、教育、文学、语言文字、历史地理、艺术、生物科学、计算机科学等社会科学和自然科学的藏书体系
与云南经济管理学院共享万方医学、维普、超星期刊 NSSD等数据库，试用资源《中国医院知识总库（CHKD）》等数据库资源
实行全开架借阅，两校区互借互还
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