INCAE商学院办学历史在美国及中美各国政府的支援下，INCAE商学院于1964年创立

哈佛商学院为该校创办机构之一，也因此该校与哈佛商学院关系密切

1963年3月23日，在一个致力于整合中美各国的活动之中，美国总统肯尼迪拜访了哥斯达黎加，与当时的危地马拉、萨尔瓦多、洪都拉斯、尼加拉瓜及哥斯达黎加元首们聚会

在该聚会里，各国元首纷纷向肯尼迪总统请求支援，以建立一套企业管理教学方案，以培养未来能担当起领导中美洲地区的企业及发展的经理人才

4月10日，肯尼迪总统写信给哈佛商学院院长，George P. Baker，信中写到感谢哈佛商学院率先关切此事

原来Baker院长派了 George Cabot Lodge, Henry Arthur 和 Thomas Raymond等三名教授来评鉴中美洲各国的商界及一般社会对于培育及改善企业领导阶层的经营能力的计划有多少程度的支持1， 结果收到了相当正面的回应

萨尔瓦多一位有名望的企业领袖，Francisco de Sola，担当了巩固支持此计划的领导角色

1963年12月，临时经营委员会被提名成立，负责率领此计划，也就是于一年后大家所认识的INCAE计划

Francisco de Sola被提名为该委员会会长，在任期间长达20年之久2

在1963年一场演说中，Francisco de Sola指出中美洲地区未来的五个问题： “在21世纪里，有五个重要挑战，若不被重视，将造成危机： 在一个急于进步的世界所面临的教育问题；在一个充满饥饿的世界里的人们所面临的粮食问题；在一个威胁我们生态的时代所面临的环保问题；在一个持续增加及逐渐贫穷的人类所面临的人口问题；以及和平问题，没和平其他方面的努力都等于白费了…” (INCAE, 最初的45年)位于尼加拉瓜Managua的El Francisco de Sola校园最先设立于1964年，之后于1984年在哥斯达黎加Alajuela设立Walter Kissling Gam校园

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