北京电子科技职业学院的特色专业有现代通信技术（5G+智能应用）、机械制造及自动化（航天定向）、游戏艺术设计（完美世界订单班）、智能网联汽车技术（百度Apollo订单）、食品检验检测技术（国家食品质量监督检验中心订单班）、机电一体化技术（智能制造方向）、飞机电子设备维修（Ameco订单班）、大数据技术（大型企事业单位数据服务方向）、城市轨道交通机电技术、供热通风与空调工程技术（机场能源管理定向）等。
北京电子科技职业学院有国家示范高职院校重点建设专业，如：生物技术及应用、数控技术、计算机网络技术、多媒体设计与制作等；还有高等职业教育创新发展行动计划(2015-2018年)认定骨干专业，如：机电一体化技术、电气自动化技术、机械制造与自动化、汽车制造与装配技术、计算机应用技术、物联网应用技术、药品生物技术、电子商务、数字媒体艺术设计等。
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