中国农业科学院研究生院学科建设根据2016年10月中国农业科学院研究生院官网显示，研究生院开设10个博士后流动站、10个一级学科博士学位点、52个二级学科博士学位点（包含30个自主设置二级学科）、17个一级学科硕士学位点、63个二级学科硕士学位点（包含30个自主设置二级学科）、1个自主设置交叉学科硕士、博士点

博士后流动站：兽医学、畜牧学、作物学、农业资源利用、植物保护、农林经济管理、生物学、园艺学、草学、农业工程 一级学科博士学位点：生物学、生态学、作物学、园艺学、农业资源与环境、植物保护、畜牧学、兽医学、草学、农林经济管理 二级学科博士学位点：生理学、微生物学、生物化学与分子生物学、生物物理学、生物信息学（自主设置）、农业生态学（自主设置）、设施农业与生态工程（自主设置）、农业气象与气候变化（自主设置）、农业区域发展与规划（自主设置）、农业水土工程、作物栽培学与耕作学、作物遗传育种、作物种质资源学（自主设置）、农产品质量与食物安全（自主设置）、药用植物资源学（自主设置）、农产品加工利用（自主设置）、作物土壤机械工程学（自主设置）、果树学、蔬菜学、茶学、观赏园艺（自主设置）、土壤学、植物营养学、农业水资源与环境（自主设置）、农业遥感（自主设置）、农业环境学（自主设置）、植物病理学、农业昆虫与害虫防治、农药学、杂草学（自主设置）、入侵生物学（自主设置）、转基因生物安全学（自主设置）、生物防治学（自主设置）、动物遗传育种与繁殖、动物营养与饲料科学、特种经济动物饲养（含：蚕、蜂等）、畜禽环境科学与工程（自主设置）、基础兽医学、预防兽医学、临床兽医学、中兽医学（自主设置）、兽药学（自主设置）、草地资源利用与保护（自主设置）、饲草遗传育种与种子科学（自主设置）、饲草生产加工及利用（自主设置）、农业经济管理、农业资源与环境经济学（自主设置）、国际农产品贸易（自主设置）、农业技术经济（自主设置）、农业信息管理（自主设置）、产业经济（自主设置）、农业信息分析学（自主设置）一级学科硕士学位点：大气科学、生物学、生态学、农业工程、环境科学与工程、食品科学与工程、作物学、园艺学、农业资源与环境、植物保护、畜牧学、兽医学、林学、草学、管理科学与工程、农林经济管理、图书情报与档案管理 二级学科硕士学位点：气象学、生理学、微生物学、生物化学与分子生物学、生物物理学、生物信息学（自主设置）、农业生态学（自主设置）、设施农业与生态工程（自主设置）、农业气象与气候变化（自主设置）、农业区域发展与规划（自主设置）、农业机械化工程、农业水土工程、农业生物环境与能源工程、环境科学、环境工程、食品科学、粮食 油脂及植物蛋白工程、农产品加工及贮藏工程、农产品加工装备、作物栽培学与耕作学、作物遗传育种、作物种质资源学（自主设置）、农产品质量与食物安全（自主设置）、药用植物资源学（自主设置）、农产品加工利用（自主设置）、作物土壤机械工程学（自主设置）、果树学、蔬菜学、茶学、观赏园艺（自主设置）、土壤学、植物营养学、农业水资源与环境（自主设置）、农业遥感（自主设置）、农业环境学（自主设置）、植物病理学、农业昆虫与害虫防治、农药学、杂草学（自主设置）、入侵生物学（自主设置）、转基因生物安全学（自主设置）、生物防治学（自主设置）、动物遗传育种与繁殖、动物营养与饲料科学、特种经济动物饲养（含：蚕、蜂等）、畜禽环境科学与工程（自主设置）、基础兽医学、预防兽医学、临床兽医学、中兽医学（自主设置）、兽药学（自主设置）、野生动植物保护与利用、草地资源利用与保护（自主设置）、饲草遗传育种与种子科学（自主设置）、饲草生产加工及利用（自主设置）、农业经济管理、农业资源与环境经济学（自主设置）、国际农产品贸易（自主设置）、农业技术经济（自主设置）、农业信息管理（自主设置）、产业经济（自主设置）、农业信息分析学（自主设置）、情报学交叉学科硕士、博士点：信息技术与数字农业（自主设置） 

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