中国科学院大学培养单位据2022年12月学校官网显示学校由京内四个校区（玉泉路、中关村、奥运村、雁栖湖）、京外五个教育基地（上海、武汉、广州、成都、兰州）和分布在全国的113个培养单位组成

学校共有直属教学科研单位75个，其中院系46个，其他各类科教机构29个

 院系中心中国科学院大学数学科学学院中国科学院大学物理科学学院中国科学院大学核科学与技术学院中国科学院大学天文与空间科学学院中国科学院大学航空宇航学院中国科学院大学工程科学学院中国科学院大学人工智能学院中国科学院大学化学科学学院中国科学院大学化学工程学院中国科学院大学材料科学与光电技术学院中国科学院大学光电学院中国科学院大学纳米科学与技术学院中国科学院大学未来技术学院中国科学院大学海洋学院中国科学院大学地球与行星科学学院中国科学院大学资源与环境学院中国科学院大学生命科学学院中国科学院大学现代农业科学学院中国科学院大学存济医学院中国科学院大学计算机科学与技术学院中国科学院大学网络空间安全学院中国科学院大学电子电气与通信工程学院中国科学院大学集成电路学院中国科学院大学经济与管理学院中国科学院大学公共政策与管理学院中国科学院大学应急管理科学与工程学院中国科学院大学知识产权学院中国科学院大学人文学院中国科学院大学马克思主义学院中国科学院大学创新创业学院中国科学院大学艺术中心中国科学院大学外语系中国科学院大学心理学系中国科学院大学中丹学院中国科学院大学国际学院中国科学院北京纳米能源与系统研究所中国科学院大学卡弗里理论科学研究所中国科学院大学环境材料与污染控制技术研究中心国际理论物理中心（亚太地区）中国科学院大学继续教育学院中国科学院大学密码学院中国科学院大学南京学院中国科学院大学杭州高等研究院中国科学院大学福建学院中国科学院大学成都学院中国科学院大学重庆学院中国科学院大学能源学院中国科学院大学宁波材料工程学院 中国科学院大学福建学院 中国科学院大学太原能源材料学院   依托培养单位数学与系统科学研究院微生物研究所近代物理研究所武汉岩土力学研究所物理研究所生物物理研究所兰州化学物理研究所武汉物理与数学研究所理论物理研究所遗传与发育生物学研究所寒区旱区环境与工程研究所武汉病毒研究所高能物理研究所农业资源研究中心青海盐湖研究所测量与地球物理研究所力学研究所北京基因组研究所西北高原生物研究所水生生物研究所声学研究所计算技术研究所新疆理化技术研究所武汉植物园理化技术研究所软件研究所新疆生态与地理研究所南海海洋研究所化学研究所半导体研究所紫金山天文台华南植物园国家纳米科学中心微电子研究所苏州纳米技术与纳米仿生研究所广州能源研究所生态环境研究中心电子学研究所苏州生物医学工程技术研究所广州地球化学研究所过程工程研究所自动化研究所合肥物质科学研究院长沙矿产资源勘查中心地理科学与资源研究所电工研究所上海微系统与信息技术研究所广州生物医药与健康研究院国家天文台工程热物理研究所上海技术物理研究所深圳先进技术研究院云南天文台国家空间科学中心上海光学精密机械研究所亚热带农业生态研究所新疆天文台光电研究院上海硅酸盐研究所三亚深海科学与工程研究所...长春人造卫星观测站自然科学史研究所上海有机化学研究所成都生物研究所南京天文光学技术研究所科技政策与管理科学研究所上海应用物理研究所成都山地灾害与环境研究所遥感与数字地球研究所信息工程研究所上海天文台光电技术研究所地质与地球物理研究所数据与通信保护研究教育中心上海生命科学研究院重庆绿色智能技术研究院兰州油气资源研究中心空间应用工程与技术中心上海巴斯德研究所昆明动物研究所青藏高原研究所北京综合研究中心上海药物研究所昆明植物研究所古脊椎动物与古人类研究所天津工业生物技术研究所上海高等研究院西双版纳热带植物园大气物理研究所山西煤炭化学研究所福建物质结构研究所地球化学研究所植物研究所大连化学物理研究所宁波材料技术与工程研究所西安光学精密机械研究所动物研究所金属研究所城市环境研究所国家授时中心心理研究所沈阳应用生态研究所南京地质古生物研究所地球环境研究所青岛生物能源与过程研究所沈阳自动化研究所南京土壤研究所长春应用化学研究所烟台海岸带研究所海洋研究所南京地理与湖泊研究所东北地理与农业生态研究所长春光学精密机械与物理研究所农业技术中心计算机网络信息中心-

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