北京大学深圳研究生院城市规划与设计学院学术研究学院设有深圳市重点建设的城市人居环境科学与技术实验室的地学基础、应用生态学和数字城市3个分室，深圳市循环经济重点实验室、北京大学—香港大学深港发展与创新研究中心、景观生态学与数字城市研究中心、中国城市设计研究中心、土地经济与房地产研究中心、生态修复与废物资源化技术研究中心及景观设计学系等科研和教学平台
同时，还设有具有独立法人资格的北京大学（深圳）国土与城市规划设计研究院
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