浙江大学医学院科研平台拥有国家重点学科4个、国家重点培育学科4个、国家临床重点专科45个

拥有一批国家级高水平科研基地，包括国家临床医学研究中心2个、国家重点实验室1个、国家国际科技合作基地2个、国家科技资源共享服务平台1个、国家协同创新中心1个、教育部前沿科学中心1个、教育部重点实验室2个、教育部工程研究中心1个、卫生健康委员会重点实验室3个

在学术期刊发表论文数、获科研经费总额等主要科研指标稳居国内医学院校前列，近二十年获国家科技进步奖和科技发明奖20项，其中特等奖1项，一等奖2项

 国家重点实验室：传染病诊治国家重点实验室 2011计划协同创新中心：感染性疾病诊治协同创新中心国家食品药品监督管理局实验室：国家食品药品监督管理局浙江呼吸药物研究实验室 教育部重点实验室：恶性肿瘤预警与干预教育部重点实验室（筹）、教育部生殖遗传重点实验室 卫生部重点实验室：卫生部医学神经生物学重点实验室、卫生部传染病重点实验室、卫生部多器官联合移植研究重点实验室 其他部级重点实验室：全军特种损伤防治药物重点实验室

国家中医药科研三级肾病免疫实验室、国家中医药科研三级中药血液病药理实验室浙江省重点实验室：浙江省生物电磁学重点实验室、浙江省组织工程与再生医学技术重点实验室、浙江省腔镜技术研究重点实验室、浙江省医学分子影像学重点实验室、浙江省医学分子生物学重点实验室、浙江省血液肿瘤（诊治）重点实验室、浙江省新生儿疾病（诊治）重点实验室、浙江省心血管病诊治重点实验室、浙江省生物治疗重点实验室、浙江省女性生殖健康重点实验室、浙江省疾病蛋白质组学研究重点实验室、浙江省传染病重点实验室 

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