南京农业大学动物医学院科研机构根据2020年3月学院官网显示，学院拥有国际级科研实验室1个，省部级科研平台3个，校级科研机构10个
国际级科研实验室：世界动物卫生组织猪链球菌病参考实验室省部级科研平台：农业部动物生理生化重点实验室、农业部动物细菌学重点实验室、江苏省动物免疫工程实验室校级科研机构：家畜生理研究室、兽医寄生虫病研究室、鱼病鱼药研究室、畜禽营养与代谢病研究室、中兽医学研究室、小动物疾病研究室、畜禽疫苗工程中心、兽药创制中心、兽药残留检测中心、畜禽疾病检测中心
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