南京农业大学生命科学学院科研平台截至2021年4月，学院建有农业农村部农业环境微生物重点实验室、江苏省农业环境微生物修复与利用工程技术研究中心和江苏省杂草防治工程技术研究中心等多个省部级科研平台
部省级工程技术研究中心：农业农村部农药残留微生物降解研发基地省部级重点（开放）实验室：农业农村部农业环境微生物学重点实验室部批研究所（室）：杂草研究室、农业微生物研究室校级重点实验室：植物生理研究所、南京农业大学-日本东京大学联合实验室、杂草研究室、环境能源工程研究所、污染物生物治理工程技术中心、农业微生物研究室
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