蚌埠医学院学科建设据2023年4月学校官网显示，学校有3个国家临床重点专科、4个省级重点学科、3个省级高校高峰（培育）学科、30个省级重点专科和重点培育专科、2个省级特色专科
3个国家临床重点专科、4个省级重点学科、3个省级高校高峰（培育）学科、30个省级重点专科和重点培育专科、2个省级特色专科
2022年2月，学校新增儿科学专业
省级重点学科：病原生物学、外科学（骨外）、骨科、血管外科、整形外科、肺科省级特色专科：风湿性免疫疾病科等校级重点学科：微生物学、病理学、药理学、外科学（骨外）、内科学（呼吸）、生理学、医学寄生虫学、人体解剖学、免疫学、生物化学与分子生物学、药剂学、基础护理学、营养与食品卫生学、放射诊断学、医学伦理学、肝胆外科学、胸心外科学、胃肠外科学、心血管病学、内分泌学、康复医学、整形外科学、外科学（泌尿外科）校级重点扶持学科：血液内科学、肾内科学、传染病学、普通外科学、外科学（骨外）、康复医学
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