中国科学院理论物理研究所合作交流据2015年9月研究所图书馆官网显示，理论物理所经开放所学术委员会或常委会批准，每年有来自全国近四十所高校和十几个科研院所的客座100多人与所内研究人员进行联合研究
每年举办20多次午餐讨论会，举办极具特色的前沿科学论坛和交叉学科论坛及各个研究领域的专题学术报告100次以上
在国际合作方面每年会举办若干次国际会议，曾与中科院数学研究院和晨兴中心一起主办超弦国际会议，参会外宾达350人；曾多次与美国SanFe研究所举办复杂系统暑期学校
在高级来访方面，理论所曾多次接待多位诺贝尔奖得主来访，2006年还两次接待美国务卿科技顾问的来访
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