中国科学院水生生物研究所设施设备馆藏资源据2016年1月该所图书馆官网显示，中国科学院水生生物研究所图书馆有藏书28万余册，拥有淡水生物学及其相关学科的研究级馆藏，以淡水生物学、水生态环境、淡水水产养殖方面的文献为资源特色

在2千2百余种期刊馆藏中，最早的西文期刊可追溯至1838年

有不少期刊，如《水生生物学报》、《水生生物学集刊》、《Hydrobiologia》、《Journal of Phycology》、 《Sinesia》等， 都是从第1期开始连续收藏的

 科研设备中国科学院水生生物研究所公共技术服务中心是服务该研究所并对外开放的技术支撑机构，为科研人员提供技术服务和技术培训，并开展相关技术的研发与推广

中心基本管理理念是集中管理、开放共享、通过网络化管理和专业化服务，实现中心管理科研仪器设备的公平、有序和高效使用

截至2013年10月，该中心有仪器设备120余台（套），总价值9200余万元

 部分仪器仪器名称仪器型号存放地点仪器图片长片段高通量测序系统Miseq分析测试中心416超高分辨质谱仪LTQ Orbitrap Elite分析测试中心402室超高效液相色谱－三重四级杆质谱联用仪ACQUITY UPLC H-class-Xevo TQ MS分析测试中心401室水下声呐成像原位观测系统Aris1800分析测试中心408室河流地质分类识别系统GD_X分析测试中心408室参考资料： 

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