中国科学院生态环境研究中心设施资源设备设施根据2020年6月官网显示，环境化学与生态毒理学国家重点实验室公用仪器设备主要包括各类荧光显微镜、高速离心机，凝胶成像系统，膜片钳系统，酶标仪，荧光PCR，激光共聚焦显微镜和基质辅助激光解析飞行时间生物质谱等，主要用于生物细胞微观结构成像和生物大分子的质量测定等

 根据2020年6月官网显示，城市与区域生态国家重点实验室设备有总有机碳总氮分析仪、元素分析仪、激光粒度仪、气相色谱仪、连续流动分析仪、全谱直读等离子体发射光谱仪、离子色谱、连续光谱酶标仪、气质联用仪、全自动快速微生物鉴定仪、微波消解萃取系统、快速熔剂萃取仪、混合研磨仪、高纯锗伽马能谱仪、高速冷离心机、液相色谱串联质谱联用仪、气相色谱仪（温室气体）、荧光定量PCR系统、稳定同位素比质谱仪、电感耦合等离子体质谱仪等设备

 馆藏资源根据2020年8月官网显示，中国科学院生态环境研究中心文献信息中心提供中国知网CNKI、CSCD、NSTL、Frontiers in China、ACS、ASM、RSC、SpringerLink期刊、ScienceDirect 、易阅通、RSC英国皇家化学学会电子图书 、Wiley电子图书、Elsevier电子图书、Springer电子图书、方正中文电子图书等数据库的使用

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