中国科学院遥感与数字地球研究所研究部门据2017年8月研究所官网显示，研究所拥有国家重点实验室1个、国家工程实验室1个、国家工程技术研究中心1个、中科院科研平台3个、省部级科研基地8个、国际组织4个
国家重点实验室：遥感科学国家重点实验室国家工程实验室：遥感卫星应用国家工程实验室 国家工程技术研究中心：国家遥感应用工程技术研究中心中科院科研平台：中科院数字地球重点实验室、中国遥感卫星地面站、中科院航空遥感中心 省部级科研基地：海南省地球观测重点实验室、国家航天局航天遥感论证中心、国家环境保护卫星遥感重点实验室、中国陆地观测卫星数据中心、国家高分专项应用技术中心、国家高分专项数据中心、喀什研究中心、三亚研究中心国际组织：国际数字地球协会、联合国教科文组织国际自然与文化遗产空间技术中心、国际科学理事会灾害风险综合研究计划国际项目办公室、CAS-TWAS空间减灾优秀中心
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