中国科学院植物研究所科研部门2014年，植物所拥有国家重点实验室2个，中科院重点实验室3个，10个野外台站、1个植物标本馆、1个中国生态系统研究网络生物分中心、1个中科院非法人研究单元——中科院内蒙古草业研究中心
国家重点实验室：系统与进化植物学国家重点实验室、植被与环境变化国家重点实验室中科院重点实验室：中科院植物分子生理学重点实验室、中科院光生物学重点实验室、中科院北方资源植物重点实验室 野外台站：内蒙古锡林郭勒草原生态系统国家野外科学观测研究站、内蒙古鄂尔多斯草地生态系统国家野外科学观测研究站、湖北神农架森林生态系统国家野外科学观测研究站、中科院北京森林生态系统定位研究站、植物所多伦恢复生态学试验示范研究站、植物所浑善达克沙地生态研究站、植物所东乌珠穆沁草原生态系统管理研究站、植物所北方林生态系统定位研究站、植物所古田山森林生物多样性与气候变化研究站、植物所内蒙古农牧业科学院乌兰察布草地生态研究站 研究所风光
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