中国科学院大气物理研究所形象标识所徽标志主体是代表地球的圆形，中间的“IAP”字母组合是中国科学院大气物理研究所的英文缩写（The Institute of Atmospheric Physics， Chinese Academy of Sciences），同时也代表“创新（innovation）、协作（association）、进步（progress）”，喻义深刻
“IAP”字母组合呈三角形的形状，象征了研究所积极向上、开拓创新、不断进步的发展方向
左下方的交叉曲线代表了地球，右下方的曲线代表海洋，与上方的代表云的曲线一起，体现了大气圈、水圈和地表相互作用这一大气科学研究的特点，涵盖了大气科学的研究领域
外圈中文文字和英文字母的结合体现大气所要立足中国、放眼世界
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