中国科学院上海药物研究所学科建设根据2016年3月研究所官网显示，中国科学院上海药物研究所研究生培养工作开始于1955年，是中国科学院研究生培养工作开展最早的单位之一
1981年被国务院学位委员会批准为首批有机化学专业、药理学专业硕士、博士学位及微生物学专业硕士学位授予单位
1994年被国务院学位委员会批准为“开展自行审定、审批博士生指导教师”的试点单位
1996年，在国务院学位委员会组织的全国有机化学专业博士学位论文抽查评比中，研究所名列第二
1998年被中国科学院批准为博士生重点培养基地
2000年经国务院学位委员会批准，获得药学一级学科博士学位授予点
截至2014年底，上海药物所共有一级学科博士研究生培养点1个，一级学科硕士研究生培养点1个，博士后流动站2个
博士后流动站：化学、药学 一级学科博士研究生培养点：药学 一级学科硕士研究生培养点：药学
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