中国农业科学院蜜蜂研究所创建初期1957年，农业部和农垦部联合召开了全国首次养蜂工作座谈会，制定了中国养蜂业的发展方针，提出了开展养蜂科研、教育的规划和措施

1958年9月，国务院科学规划委员会批复同意在1958年准备新建大豆、油菜、草原、麻类、家禽、养蜂、农田灌溉等22个专业研究所和蔬菜研究室

10月初，中国农业科学院养蜂研究所在《中国养蜂》杂志室的基础上于成立

1959年1月，根据国务院批文关于“中国农业科学院建立的专业研究所均由所在省负责领导，有关全国性的业务和技术研究，则由中国农业科学院负责领导”的精神

养蜂所在成立初期成为中国农业科学院和北京市农林科学院双重领导体制

1960年1月，朱德给中央写信，提出“发展养蜂这件事有大大提倡一下的必要”

当朱委员长了解到养蜂所当时的所址条件困难时，即指示解放军总后勤部将北京市香山卧佛寺旁废弃不用的广惠庵营房移交给养蜂所，并于1960年2月为养蜂所写下了“蜜蜂是一宝，加强科学研究和普及养蜂，可以大大增加农作物的产量和获得多种收益”的题词

养蜂所建所初期的机构设置：所部只设有办公室，科研工作以研究组的形式开展科研工作，研究组设有蜜蜂饲养技术组、品种组、蜜蜂病虫害防治组、蜜源及蜜蜂授粉组以及试验蜂场和《中国养蜂》杂志部

1962年3月，养蜂所成立学术委员会

6月，养蜂所建制由中国农业科学院从北京市收回，有职工28人

从1963年开始，每年新分配大中专毕业生均在15人左右，同时还从有关部门调入科研骨干，至1965年在所人员达百余人；逐步在原研究组的基础上成立研究室，设有蜜蜂品种研究室、蜜蜂保护研究室、蜜源授粉研究室

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