中国农业科学院农业环境与可持续发展研究所设备资源截至2013年10月，研究所拥有科研用仪器设备1076台（套），其中2万美元以上的大型仪器设备100台（套），仪器设备总价值1亿多元人民币
截至2012年6月，研究所分析测试中心拥有同位素质谱仪、元素分析仪、液质联用仪、气质联用仪、高效液相色谱仪、气相色谱仪、近红外分光光度计、原子吸收分光光度计、荧光分光光度计、紫外可见光分光光度计、全自动凯氏定氮仪、激光粒度分析仪、微波消解系统、高速冷冻离心机及超低温冰箱等仪器设备，设备总价值超过2700万人民币
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