中国科学院院刊影响因子据2018年9月16日中国知网显示，《中国科学院院刊》总被下载1095529次、总被引27664次、（2017版）复合影响因子为1.560、（2017版）综合影响因子为1.026
据2018年9月16日万方数据知识服务平台显示，《中国科学院院刊》被引量为13783次，下载量为62563次；据2015年中国期刊引证报告（扩刊版）数据显示，《中国科学院院刊》影响因子为1.62，在全部统计源期刊（6194种）中排第507名，在自然科学总论（73种）中排第3名
据2017年中国知网统计，近年来其期刊综合类影响因子在全国共430种综合类科技期刊中为前3名，其“智库”型传媒的权威性已得到科技界和社会的认同
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