中国科学院新疆生态与地理研究所科研成果根据2015年12月研究所官网显示，研究所自建所以来共获科研成果奖励265项，其中获联合国UNEP奖2项，国家级奖励21项；共申请专利82项，获专利授权40项，计算机软件登记12项，新品种审定7项

两所合并以来，获国家及省部级奖励66项，其中获国家奖励7项，两项成果获评中国年度十大科技进展；申请专利71项，获专利授权38项；计算机软件登记12项，新品种审定7项；发表学术论文1976篇，出版专著68部

主持了国家“973”、国家攻关（支撑）、国家重点基金、国家“863”、国家重大工程和院重大等项目，项目涵盖了基础研究、应用基础研究和应用研究的三大类别

 2014年，新疆生地所共有在研项目409项（包括新增项目164项）

其中，主持国家重点基础研究发展计划（973）项目2项、承担（或参加）课题14项（新增6项）；主持（或承担）国家高技术研究发展计划（863）课题1项；主持（或承担）国家科技基础性工作专项2项；主持国家科技支撑项目1项、承担（或参加）课题9项（新增2项）；主持科技部成果转化项目1项；主持和承担国家级其他类型项目5项；主持（或承担）国家自然科学基金重点项目2项、面上项目42项（新增15项）、青年基金项目46项（新增15项）、新疆联合基金本地优秀青年基金5项（新增2项）、新疆联合基金重点支持项目3项（新增2项）、新疆联合基金培育项目2项（新增2项）、国家自然科学基金重大研究计划重点课题1项；主持（或承担）中国科学院战略性先导科技专项课题5项；主持（或承担）院重点部署项目5项；承担院“西部之光”项目49项（新增12项）；承担院其他各类项目30项（新增13项）；承担自治区及其他省部级项目35项（新增10项）；承担国际合作项目10项（新增2项）；承担院地合作项目9项（新增5项）；研究所自主部署项目35项（新增19项）

 2014年，发表论文623篇，其中SCI论文171篇，出版学术专著10部，申请专利37项，授权专利24项

获自治区科技进步奖5项，其中突出贡献奖1项，一等奖1项，二等奖1项，三等奖2项

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