中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所合并建所1999年，中国科学院上海植物生理研究所、中国科学院上海昆虫研究所整合成立中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所
2015年7月，植物生理生态研究所获批独立成为中国科学院分子植物科学卓越创新中心
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