新疆维吾尔自治区农业科学院学术资源据2018年4月官网资料显示，新疆农业科学院图书馆有馆藏农业类图书10万余册，中外文期刊合订本2万余册，中文、外文农业期刊2千余种，内刊、资料6万种，22万册
订购各种报刊、杂志千余种，各语种藏书30万册
此外尚有联合国粮农组织（FAO）专藏及自建中文内刊文献数据库收录资料从60年代、80年代、90年代到至今有关水稻、玉米、棉花、甜菜、油菜、红花、蓖麻等资料3万余条
图书馆有中外文信息资源25种
外文专题资源15种，其中全文文献有8种，文摘与题录7种；中文信息资源有11种，其中中文期刊数据库资源3种（维普中文科技学术期刊全文数据库、万方数据资源系统等），特色资源数据库6种（中亚五国专业数据库、新疆棉花产业综合等六种特色资源数据库、重要报纸、博硕士论文等专业数据库），知识产权信息网2种（中国知识产权网、扬凌农业知识产权信息网），联合国粮农组织FAO专藏、电子图书等
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