内蒙古科技大学包头医学院第一附属医院科室设置医院设有神经内科、肿瘤内科、肾内科、消化内科、呼吸内科、血液内科、心内科、心脏血管外科、神经外科、泌尿外科、胸外科、肿瘤外科、微创外科、普外一科、感染疾病科、中医科、风湿免疫科、肛肠科、内分泌科、癫痫中心、皮肤科、重症医学科、蒙医骨伤科、准分子治疗中心、骨科、骨科康复、烧伤整形科、妇产科、儿科、眼科、口腔科、耳鼻喉科、导管室、针灸康复科、中心实验室、核医学科、介入治疗科、检验医学科、物理诊断科、高压氧仓、检验科等临床和医技科室
其中，风湿免疫科、神经外科被评自治区重点学科，骨科、麻醉科、介入放射科、神经内科、产科、心血管内科、内分泌科、消化内科、皮肤与性病科、感染疾病科为包头市重点学科
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