复旦大学科学技术研究院组织结构科学技术研究院由副校长、中国科学院院士金力兼任院长，设常务副院长1名、副院长4名
武利民任常务副院长，主持日常工作；艾剑良、孙逊、周曦任分管副院长
科学技术研究院下设纵向研究处、项目管理中心、产学研合作处、技术转移中心、基地建设与成果管理处、国际合作办公室、医学科研处、军民融合研究办公室、综合办公室等9个副处级机构
其中，医学科研处接受科学技术研究院与上海医学院的双重领导
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