上海医药工业研究院有限公司格局完备现有科研部门5个(化学制药部，生物制药部，中药制药部，制药装备研究室，药理研究室
国家重点实验室（创新药物与制药工艺重点实验室）（筹）1个
国家有关部委在研究院设立的国家级中心4个(国家上海新药安全评价研究中心，国家医药工业信息中心，国家药物制剂工程研究中心，国家药品包装材料检测中心)
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