上海医药工业研究院有限公司成果众多院科研机构设置及科研方向涵盖了整个药学领域，1800余项科研成果推广到我国31个省、市、自治区转化为生产力
70年代以前国内医药行业吸纳的科研成果大多出自研究院
改革开放以来，研究院推出的溶血栓药物“高纯度尿激酶”、抗肿瘤抗生素“阿霉素”、一类新药“呋喃丙胺”“头孢硫脒”“胶原酶”、维生素B6恶唑还原合成新工艺、依托泊甙生产工艺、维生素C生产工艺等一系列创新性成果，有力推动了我国医药工业的升级换代，改变了对国外相关药物的进口依赖
申报专利总数568项，获授权专利117项，拥有新药证书265本
获国家科技发明奖14项，国家科技进步奖16项，省部级科技进步奖300余项
尤其是2005年以来，研究院连续4年获得国家技术发明奖、国家科技进步奖多项
沪深股市医药板块中30余家上市公司，以研究院输出的成果作为主要产品
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