上海自然科学研究所出版物为了向广大学界人士介绍研究所的研究成果，发行两种机关报，即《上海自然科学研究室简报（简称简报）》和《上海自然科学研究所日报（简称日报、英文或日文出版）》，向日本、中国、欧美及其他各国的主要学术研究团体、大学、图书馆和学会公布
同时，作为参考的出版物有：《中国文化情报》、《中国杂志目录索引》、《本研究所图书杂志分类目录及增补篇目》
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