中国卫生信息学会机构设置学会现有统计理论与方法专业委员会、健康统计专业委员会、医院统计专业委员会、卫生统计学教育专业委员会、卫生管理统计专业委员会、电子病历与医院信息化专业委员会、公共卫生信息专业委员会、健康档案与区域卫生信息化专业委员会、卫生信息标准专业委员会、卫生信息安全与新技术应用专业委员会、卫生信息学教育专业委员会、健康卡应用与管理专业委员会、远程医疗信息化专业委员会、妇幼保健信息专业委员会、卫生地理信息专业委员会、中医药信息化专业委员会、健康医疗大数据人口信息化专业委员会、健康医疗大数据家庭健康专业委员会、健康医疗大数据食品安全与卫生营养专业委员会、健康医疗大数据产业发展与信息安全专业委员会（中国互联网医疗健康产业联盟）、健康医疗大数据老年保健专业委员会、健康医疗大数据药物与器械专业委员会、健康医疗大数据人力资源开发专业委员会、健康医疗大数据国际合作与交流专业委员会、健康医疗大数据政府决策支持与标准化专业委员会等25个专业委员会
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