国家烟草改良中心主要任务组织全国科研联合攻关，解决烟草育种工作和烟叶生产中的重大技术问题；组织全国烟草种质资源的搜集、引进、鉴评、保存、交流和交换工作，为全国烟草育种单位提供优良的亲本材料和种质；开展烟草育种理论与方法的研究，为新品种选育提供技术保障和技术储备；选育适宜于全国不同烟区种植的烟草新品种；建立全国烟草品种示范推广体系；受政府委托，代表国家同国际上相关科研组织和机构开展国际合作；开展人才培养工作；开展学术交流与信息共享
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