复旦大学生物医学研究院技术平台已建成的技术平台有：蛋白质组学技术平台、分子细胞技术平台、药物与结构技术平台、基因组学技术平台、病理研究技术平台、基础医学技术平台（癌症，心血管）、公共技术平台、重点建设的技术平台有：干细胞与组织工程技术平台、病原微生物与传染病技术平台、表观遗传学技术平台
现已拥有价值40万元以上的大型仪器19台，包括大型质谱仪、测序仪、显微切割仪、流式细胞仪、小动物活体成像仪、小动物超声、多功能工作站、多功能扫描仪、DNA合成仪等
通过开放共享的机制，研究院将为校内外生物医学研究工作者提供高水平的技术支持和服务
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