南京市疾病预防控制中心中心实验室中心实验室于2003年通过了实验室国家认可，到2010年通过认可项目已达10大类474项，同时通过江苏省质量技术监督局计量认证566项，拥有气相色谱仪、高效液相色谱仪、离子色谱仪、气-质联用仪、原子吸收分光光度计、等离子发射光谱仪、原子荧光光度计、总有机碳测定仪、全自动测汞仪、全自动水份测定仪、凯氏定氮仪、全自动滴定仪、全自动结核杆菌快速鉴定仪、全自动生化分析仪、全自动细菌鉴定仪、全自动酶联免疫检测仪、荧光定量PCR仪、蔡司生物显微镜、荧光倒置显微镜、Ⅲ级生物安全柜、低温冰箱、厌氧培养箱、CO2培养箱等先进仪器设备，其中万元以上270余台（件），价值约2500万元
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