重庆市精神卫生中心科室设置开设特色科室有：普通精神科，老年精神科，开放式心理科，精神疾病早期干预科，医学心理咨询中心，精神康复治疗训练科、心理测验室等，由知名专家、教授指导诊治，采用药物治疗、心理治疗、生物反馈治疗、无抽搐治疗、精神康复治疗(包括艺术治疗、体疗、技能训练)等
除了以上特色科室门诊外，还开设心理咨询、个别心理治疗、家庭心理治疗、团体心理治疗等
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