电子显微学报影响因子1992—1993年,《电子显微学报》名列“中国自然科学核心期刊”第73名
1996年,按影响因子排序列中国科技期刊工程技术类刊物第三名
1994年起,连续被列入“被引频次最高的中国科技期刊500名排行表”
1998年,在“CA被引频次最高的国际科技期刊一千名排行表” 中第587名
2003年,《电子显微学报》影响因子提高到0.404,在全国1534种来源期刊中列第352名、在全国电子通讯类53种来源期刊中列第6名;其被引频次在全国电子通讯类53种来源期刊中列第15名
据2018年11月28日中国知网显示,《电子显微学报》总被下载740422次、总被引19877次、(2018版)复合影响因子为0.635、(2018版)综合影响因子为0.442
据2018年11月28日万方数据知识服务平台显示,《电子显微学报》被引量为12319、下载量为126337;据2015年中国期刊引证报告(扩刊版)来源数据显示,该刊影响因子为0.431,在全部统计源期刊(6735种)中排第3290名,在无线电电子学与电信技术、物理学、基础科学(961种)中排第498名
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