清华大学学报荣誉表彰1999年，获得首届国家期刊奖
2006年，《清华大学学报（哲学社会科学版）》在《新华文摘》、《中国社会科学文摘》、《高等学校文科学术文摘》三大权威文摘的文摘率居中国社会科学期刊文摘率第1位
2002年，获得第二届国家期刊奖
2004年，获得第三届国家期刊奖提名奖
2008年，学报中文版被评为“首届中国精品科技期刊”
2011年，《清华大学学报（自然科学版）》在工程与技术类大学学报中的综合评价总分排名第一，再次被授予“中国百种杰出学术期刊”称号
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