中国菌物学会学术期刊《菌物学报》（曾用名《真菌学报》《菌物系统》）1982年创刊，月刊，是中国科学院主管的中国科技核心期刊，报道菌物（真菌、粘菌、卵菌等）学研究领域的研究成果，也是国际菌物学界信赖的刊物，被中国国内外多家权威检索系统收录

 《菌物研究》系中国菌物学会和吉林农业大学主办，中国国内外公开发行的综合性学术性期刊

该刊以登载有关菌物学（主要包括菌物生物学、菌物分类、菌物生态、菌物资源、菌物遗传与育种、菌物药化与药理、菌物栽培与加工、菌物药与功能食品开发等理论和应用方面）的综述、原创论文、研究报告、研究简报等为主

其宗旨是反映菌物的最新研究成果，促进中国国内外的学术交流与合作

 《Mycology：an International Journal on Fungal Biology》（《真菌学（英文）》）是中国菌物学会2010年与英国Taylor & Francis Group合作，创办的中国首个菌物学期刊

该刊发表的文章涵盖真菌学的各个领域，包括真菌、真菌类有机体和地衣在分类学、系统发育学、基因组学、进化生物学、生态学和生物多样性、基因和分子生物学以及次级代谢产物等方面的研究

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