中国海洋大学海洋药物教育部重点实验室合作交流实验室注重与国内外知名的科研院所开展广泛的学术交流与合作，先后与中国医学科学院北京药物研究所、中国科学院上海药物所、中国科学院上海有机所、中国科学院昆明植物所、军事医学科学院、中国预防医学科学院等科研院所建立了长期有效的合作关系；与美国Iowa大学、美国Michigan大学、瑞典Upsalla大学、德国Duesseldorf大学、法国Brest大学、丹麦Roskilde大学、加拿大McGill大学、法国Ifremer海洋研究所等研究院所在资源共享、人员互派、学术交流、科学研究等方面建立了密切的合作关系
对外交流的扩大与合作的深入促进了实验室对外影响与整体地位的稳步提高
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