里昂国立应用科学学院博士生院拥有600余名博士生，隶属在8个博士生院（Ecole Doctorale）（里昂大学博士生院），均隶属于法国高等教育和科研部
博士课程在里昂大学博士生院内完成，课题研究在里昂的各大实验室内进行，博士生毕业时须完成课题研究及通过论文答辩，被里昂大学授予博士学位（Doctorat de l’Université de Lyon），为法国国家博士文凭（Diplôme National de Doctorat）
里昂化学博士生院电气及自动化博士生院生物学博士生院卫生与交叉科学博士生院信息与计算科学博士生院里昂材料学博士生院机械工程、土木工程及声学博士生院社会和政治学博士生院
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