成都市农林科学院科研部门根据2020年9月科学院官网显示，成都市农林科学院设有9个个研究所；建有国家改良中心分中心1个，国家原原种繁殖基地1个，国家现代农业产业技术体系综合试验站3个，四川省原原种脱毒快繁基地1个，成都市级工程技术研究中心2个；此外还是四川省畜牧科学研究院成都分院、四川省林业生态环境监测中心成都分中心
国家改良中心分中心（1个）：国家油菜改良中心四川成都分中心国家原原种繁殖基地（1个）：国家油菜原原种繁殖基地国家现代农业产业技术体系综合试验站（3个）：国家现代农业产业技术体系成都油菜综合试验站、国家现代农业产业技术体系成都马铃薯综合试验站、国家现代农业产业技术体系成都蔬菜综合试验站四川省原种脱毒快繁基地（1个）：四川省马铃薯原原种脱毒快繁基地成都市级工程技术研究中心（2个）：成都优质油菜工程技术研究中心、成都优质蔬菜工程技术研究中心研究所（9个）：都市现代农业与信息研究所、园艺研究所、作物研究所、农业装备研究所、林业研究所、水产研究所、农业生物环境与能源研究所、畜牧研究所、农产品加工与贮藏研究所
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