江西省科学院科研部门据2018年7月科学院官网显示，科学院拥有6个省属独立研究所，6个院研发中心，拥有4个省级工程技术中心，3个省级重点实验室，4个省级优势科技创新团队，设有江西省科学院院士工作站
省级重点实验室：江西省铜钨新材料重点实验室、江西省观赏植物遗传改良重点实验室 省级工程技术中心：江西省重金属污染生态修复工程技术中心、江西省天然产物绿色加工工程技术研究中心、江西省水污染控制及其能源利用工程技术研究中心、江西省生物化工工程技术研究中心 省属独立研究所：生物资源研究所、能源研究所、微生物研究所、应用物理研究所、应用化学研究所 、科技战略研究所 省级科技创新团队：鹅掌楸属种质资源与种质创新团队、水污染控制与资源化知识创新团队、稀土铜材料技术创新团队、乳酸及其衍生物技术创新团队 院研发中心：高科技开发中心、计算机培训中心、计算机信息中心、食品工程创新中心、低碳经济研究中心、鄱阳湖研究中心
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