云南省社会科学院科研部门截至2017年1月，云南省社会科学院有17个直属研究所，2个云南省级研究基地，2个云南省级创新团队，1个云南省哲学社会科学创新团队；设有办公室、科研处、人事教育处等8个管理处室，图书馆、信息中心等3个科辅机构；在院内成立了8个研究中心、18个科研工作室，与13个州(市、县)联合共建了16个社科院（研究院、所），14个“科学研究与社会服务基地”

 直属研究所：南亚所、东南亚所、民族学所、社会学所、民族文学所、农村发展研究所、历史文献所、马列所、宗教所、哲学所、经济学所 云南省级研究基地：宗教理论与政策研究基地、云南藏区建设与发展研究基地 云南省级创新团队：云南面向南亚开放理论与实践创新团队 、云南高原特色农业理论与实践研究创新团队 云南省哲学社会科学创新团队：云南省哲学社会科学创新团队 研究院所马列主义毛泽东思想研究所哲学研究所东南亚研究所南亚研究所经济研究所民族学研究所民族文学研究所社会学研究所历史、文献研究所宗教研究所农村发展研究所印度研究所孟加拉国研究所缅甸研究所越南研究所老挝研究所泰国研究所---资料来源： 其他研究机构邓小平理论研究中心云南全面建设小康社会研究中心社区发展研究中心云南省情研究中心云南经济开发研究院云南文化发展研究中心云南妇女研究中心云南省社会科学院职业化教育研究中心影视人类学摄制中心资料来源： 州市院所保山分院 曲靖分院西双版纳分院怒江分院楚雄彝族文化研究所丽江分院暨丽江东巴文化研究院红河民族文化研究所曲靖文化研究所大理民族文化研究所宁蒗彝族文化研究所墨江哈尼文化研究所迪庆分院暨藏学研究所资料来源： 

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