甘肃省农业科学院历史沿革清光绪三十二年（1906年），甘肃省在兰州西贡院设南北农业试验场，翌年在兰州小西湖设试验外场

清宣统三年（1911年）两场停办

民国二年（1913年），西贡院农试场重新开办

民国十七年（1928年）以西贡院农试场为基础，改设为第一农事试验场，并在天水、平凉、武威、张掖、酒泉分别设立第二、三、四、五、六农事试验场，在兰州庙滩子设河北农事试验场

民国二十七年（1938年），经甘肃省政府核定将经济部西北种畜场、甘肃省第一农事试验场、兰州小西湖苗圃等机构合并改组成立甘肃省农业改进所

民国二十八年（1939年），甘肃省农业改进所所址迁入兰州雁滩农场

民国二十九年（1940年），甘肃省农业改进所与行政院农产促进委员会合作办理农业推广事宜，所内增设农业推广处，并设榆中农推试验县办事处及天水、泾川、临洮3个农业推广所，1月，在岷县、平凉、张掖分别设第一、二、三区农试场

民国三十年（1941年），甘肃省农业改进所下增设皋兰农试场和兰州农业推广所，并从浙江大学农学院聘请一批农业科技人员来甘肃工作

民国三十四年（1945年），为增强推广事宜，所下增设酒泉、清水、静宁3个农业推广所

1949年8月31日，中国人民解放军兰州市军事管制委员会接管甘肃农业改进所，同年10月25日，甘肃行政公署第一次专员联席会议决定恢复甘肃农业改进所

1950年2月后改名为甘肃省人民政府农林厅农业改进所

1962年5月，经济作物研究所并入粮食作物研究所，改为作物研究所

1964年经国家农业部批准，由中国农业科学院和甘肃农业科学院共同在甘谷建立了“甘谷小麦锈病试验站”（1966年“文革”开始后撤销）

1965年9月院部又迁到邱家湾玻璃厂旧址，与园艺、植物保护两个研究所一起办公，并在此基础上建设新院址

1966年，“文革”开始后，农科院的科技人员大多集中在院部参加“文化大革命”，科研工作基本处于停顿状态

1967年2月5日，农科院职工群众组织夺了院、所的领导权，由院、所职工群众推选代表组成“甘肃农科院临时生产管理委员会”，领导全院的科研生产工作

1968年4月11日，甘肃省革命委员会批准将“甘肃农业科学院”改称为“甘肃省农业科学院”，并成立甘肃省农业科学院革命委员会

同年10月31日，按照省革命委员会指示，甘肃省农业科学院又迁回武威黄羊镇

1969年2月4日，甘肃省革命委员会决定，撤销甘肃省农业科学院

1969年10月，在原甘肃省农业科学院的基础上成立甘肃省农牧业管理局下属的甘肃省农业科技工作队（县级）革命委员会筹备小组

1972年12月，在甘肃省农业科技工作队的基础上恢复县级建制的甘肃省农业科学院，隶属省农业局领导

1973年7月3日，根据甘肃省农业局指示，中共甘肃省农业科学院委员会研究决定，恢复粮食作物、土壤肥料、植物保护、园艺4个专业研究所，民勤治沙站也划归省农科院领导

1975年，建立经济作物和林业两个研究所，张掖九公里园艺场全部划归省农业科学院

1975年6月，甘肃省农业科学院由县级改为地级，隶属省农业厅领导

1978年8月，甘肃省农业科学院在《甘肃农业科技》组和图书资料室的基础上，成立了科技情报研究所；同时将林业科学研究所和民勤治沙站划归省林业厅领导

同年10月，将园艺所分解为果树研究所和蔬菜研究所

1979年1月，经中共甘肃省委批准，撤销省农科院革命委员会，实行党委领导下的院长分工负责制

同年4月，院水产组扩建为水产研究所

1982年，经甘肃省人民政府批准，省农科院院址再次由武威黄羊镇迁回兰州市安宁区刘家堡

1985年，甘肃省农科院的兰外各专业所均已迁入兰州，基本完成了集中建院任务

2001年4月30日，组建“甘肃省农科院生物技术中心”和“甘肃省农科院农产品贮藏加工研究中心”

2006年11月4日，撤销甘肃省农业科学院粮食作物研究所、经济作物研究所，农业测试中心和兰州试验场

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