台湾大学医学院学术研究在学术研究方面，该院学术研究凭借前辈的努力与耕耘，至今累积了丰硕的成果，并在台湾学术研究领域中占有一席之地，且于医学研究领域独占鳌头
而为了更上层楼，及提升整个医学研究水平，该院于1996年配合校研发会正式成立研究发展室，整合并有效运用医学院、附设医院及公卫学院之研究环境；利用有限经费集中购置精密仪器、改进学术研究相关制度、依重点发展需要，成立跨领域、整合性之群体研究计划，并统筹办理医学校区学术研究相关之行政事务
此外，在研究计划方面，该院学术研究计划经费主要来源为国科会、卫生署、政府相关机构及财团法人委托计划等
该院及附设医院则依循“仪器共享、资源共享、基础临床整合、协助新进同仁、详实追踪、奖励发表”之原则，编列相关研究经费，推动学术研究发展，成效卓著
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