台湾大学医学院学生活动重视社团活动是台大的一项优良传统，该院秉持这样的传统，自日治时代起师生即积极参与社团活动，光复后，各项社团活动亦非常踊跃，提供学生一个舒展身心、运动交流、提升人才素养及一探艺术殿堂奥妙的快捷方式

除了以各系所为主的各系学会、研究生互助会外，该院学生社会服务性社团（学生社会服务团、渔服医疗服务队等），亦为一个常态性社团，每年寒暑假的医疗服务成为该团的活动之一

传统医学研究社则以建立完整的针灸治疗评估，并能服务矿区山地的乡民，成绩卓著

在艺文社团方面，主要包音乐演出活动为主的杏林弦乐团、合唱团；医学院自然保育社、绘画与美学的绿野社、杏林浪漫摇滚社、强调人文精神的文学创作社，以及以摄影为主的医影社

此外，在宗教励志社团方面包括晨曦佛学社（医法分部）及医心社

体育社团方面包括足球队、桌球队、网球社、田径队、合气道社、篮球社、棒球社、羽毛球社、橄榄球队等等

该院学生在上述多彩多姿的社团生活中，为平日沉重的课业增添不少色彩，透过这些社团活动，不仅找到自我，同时也触及另一种医学教育面，身心所感受，皆是医学教育本质对生命的一种理想与期许

该院与学生相关事务，诸如课外活动，各项奖学金申请案及学生生活辅导等皆由学生事务分处负责执行与协调

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